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如何正確獲取離體根系圖像

點擊次數(shù):1157 發(fā)布時間:2022-10-08

分析原理

       通過掃描儀將離體洗好的根系掃描獲取圖像,使用專業(yè)根系分析軟件對根系圖像分析,得到根系長度、平均直徑、表面積、體積、根尖數(shù)等根系表型數(shù)據(jù)。分析的直接對象是圖片,所以獲取高質(zhì)量的根系圖片獲得準確數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)。

         適用于DJ-GX02根系分析儀。

適用對象:

離體洗根后的植物根系

圖像獲取設(shè)備:

        儀器標配含有經(jīng)過嚴格校準的掃描儀以保證圖像的質(zhì)量。每臺掃描儀配有專用控制軟件,用于參數(shù)設(shè)置和圖像獲取、保存。

       如果使用普通掃描儀,只有掃描頭部位的光源,也就是下方照光,因為根系的立體結(jié)構(gòu),根系在背景板上會留下陰影,掃描出來的圖像上,根系附近就有陰影,圖像不夠清晰,影響分析。


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       雙光源投射掃描,上方照光,下方掃描成像,得到根系的投影。由于光源來自于上方,沒有根系的地方將是白色的背景,有根系的地方光受根系遮擋,根系呈現(xiàn)黑色,四周邊界清晰,根與背景區(qū)分非常明顯,對分析非常有利。

圖片關(guān)鍵詞圖片關(guān)鍵詞

掃根成像:

      使用投射掃描時,需要將上光源的背景板取下,否則背景板將上光源遮擋,掃描的圖像將一團黑。

圖片關(guān)鍵詞 圖片關(guān)鍵詞

        放置定位框,按照如圖所示的方向,注意定位框凹陷一端(箭頭所指)的位置。為了放置根盤直接壓在上光源玻璃板上,隨貨配有增高墊,如左下圖所示,放置在面板上。

圖片關(guān)鍵詞 圖片關(guān)鍵詞


洗好的根系放置在根盤內(nèi),隨貨配有3種不同尺寸的根盤,選擇適合根系大小的,放入根系和清水,細小的根系在水中會分散開,便于成像。

 對于根系基部比較大的根系,比如樹苗、玉米的根,可將根系分別剪下來,平鋪到根盤中;

 如果一個根系上根的數(shù)量很大,可以分多次掃描,分析時將根盤的數(shù)據(jù)累加;

圖片關(guān)鍵詞

     掃描根系可以提前預(yù)覽,保存只有根系的圖像,拋棄根盤的區(qū)域,便于后面軟件直接自動分析。

圖片關(guān)鍵詞


掃描參數(shù)的設(shè)置:

        掃描參數(shù)決定了掃描圖像的質(zhì)量,參數(shù)中最為關(guān)鍵的是分辨率,一般設(shè)置300ppi即可,滿足絕大多數(shù)樣品的成像需求;如果樣品非常細小,可以選擇更高的分辨率值,比如600ppi;設(shè)置是在成像控制軟件界面。更高的分辨率意味著圖像占的內(nèi)存更大。

圖片關(guān)鍵詞

    圖像掃描完成后,要保存到計算機硬盤中,選擇jpg、tiff均可。建議先將所有根系的圖像全部掃描完成后再進行圖像分析,軟件有批處理分析功能。

3副根系掃描圖

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